Bitkisel yağ üretim proseslerinde de diğerlerinde olduğu gibi “KATI,SIVI,GAZ” yakıt tipleri enerji kaynağı olarak kullanılmaktadır. Gaz tipi yakıtların abonelik ve teminat gibi ciddi ekstra maliyetleri bulunmaktadır. Fuel oil gibi sıvı yakıtların birim maliyetleri de son derece yüksektir. Kömür gibi katı yakıtlarda ise depolama alanı zorunluluğu, standartlara uygun kaliteli hammadde temini, sürekli personel zorunluluğu ve düzenli bakım maliyetleri vardır. bunların yanı sıra yarattığı çevre kirliliği en büyük sorunların başında gelmektedir.